Автором идеи создания "Микропии" является директор королевского зоологического парка Нидерландов Хэйг Балян, а сам комплекс зоопарка микробов расположен рядом с королевским зоопарком Artis. По словам Баляна, в обычных зоопарках представлена лишь небольшая часть живой природы, а между тем микробы необходимы для выживания человечества и играют важную роль для будущего Земли.

Стоимость проекта составляет порядка 10 миллионов евро. Помещения напоминают огромную лабораторию. Там установлены микроскопы, которые в свою очередь подключены к большим экранам. Посетители могут понаблюдать за жизнью бактерий в чашках Петри, за их размножением, увидеть, чем одни виды отличаются от других.

Музей интерактивен — с помощью специального сканера можно выяснить, сколько бактерий в данный момент находится на теле посетителя, а прибор Kiss-o-Meter покажет, каким количеством бактерий влюбленные обмениваются при поцелуе.